De Bongerd wordt bestuurd door de Stichting Primair Openbaar Onderwijs Ede (Stichting Proominent). Deze stichting ondersteunt de scholen met centrale diensten op het gebied van organisatie, personeelszaken, beleid en het contact met overheid en politiek.
Directeur-bestuurder is de heer Bert Dekker, hij werkt vanuit zijn stafkantoor:

Stichting Proominent (Primair Openbaar Onderwijs Ede)
Horapark 3
6717 LZ Ede


Internet: http://www.proominent.nl
Telefoon: 0318-611631
E-mail: secretariaat@proominent.nl


Vanaf april 2014 is er een scheiding aangebracht tussen bestuur en toezicht. Het toezicht is in handen van de Raad van Toezicht, bestaande uit vijf leden.